Loimaan aluesairaalassa toimii kolme eri toiminnallista kokonaisuutta:

• akuutin hoidon toiminnallinen kokonaisuus
• kirurgisen  hoidon toiminnallinen kokonaisuus
• konservatiivisen hoidon toiminnallinen kokonaisuus

Kaikkia toiminnallisia kokonaisuuksia tukee fysioterapiayksikkö.